劳动合同与员工手册的劳动制度不相符，员工手册的规定还是否合法？ 公司向相关部门申请的劳动制度是综合计算工时劳动制。与公司签订的劳动合同中明确著名实行综合计算工时劳动制，但同样被要求强制签名的员工手册中确解释由于岗位特殊性而实际实施的是不定时工作制，只给予补休没有加班工资。在实际工作中由于频繁加班导致实际上既没加班费也做不到补休。
劳动合同以及员工手册都经过签名存档。请问员工手册是否合法，员工可否申请劳动仲裁申请超出标准工作时间以外工作时间的加班工资？