怎么样规避风险 ２０１１年我与他人合伙开办了一家修理厂，因为是亲戚关系，当时所有的证件都是委托对方办理，费用均摊，其中包括道路经营许可证，工商营业执照等，但办理的是个人独资企业，且是对方的法人，事后我们补签了合伙协议，明确了双方各占百分之五十的股份，合伙经营此修理厂。
现在对方要退出，双方已签定了股份转让协议，但现在过不了户，如果我接手过来单独做，用现在的证件，在法律上有没有问题，对我方有风险吗？又该怎么规避？