我公司与甲公司存在常年的施工合作关系，但是在2013年底建设工程施工合同已到期，因甲公司不具备我公司

我公司与甲公司存在常年的施工合作关系，但是在2013年底建设工程施工合同已到期，因甲公司不具备我公司要求的施工资质，未再与其签订合同，同时在2015年以开会的形式协商将甲未施工完毕的4个工程（其中包括竣工验收不合格的2个）转给乙公司，同时工程款也与乙结算，我公司部再付款给甲公司。但是今年甲将我公司和乙公司同时列为被告，要求我公司支付工程款。理由是其多次向乙公司催要，但是乙以我公司未付款为由不给甲。但是事实是我公司已在4个工程全部竣工验收合格交付后，今年7月已将工程款付给了乙公司。请问，本案我公司应怎样为自己辩护？