既然是违章建筑，那就没有补偿。

可以提出主张。

可以要求，该违章门面房既然能取得营业执照，可能在一些行政机关有一些合法的手续存在（针对此种情况，南京市有些特殊规定），并且你的确也受到了损失。
但是你所列的情况描述太简单，视金额多少，律师可以接受委托，尽可能维护你的合法权益。