协商解决。

你的复制应用就是抄袭。
如果是你自己做的教学文件，就算内容一样，基于个人思维的逻辑，语言表达的不同，也会有不同的文章结构和语言组织。抄袭是侵犯著作权的一种行为，和是否获得利益无关。
请根据律师函的要求，进行相关的处理，比如回函表示认错等。
如果律师函的要求很难实现，也请积极沟通协商解决。
如果实在解决不了，那么首先您先停止侵权行为，其次等待对方的处理。