您是不是承包的是部队的工程呢？ 从您的叙述看，工程量应当是没有问题的，关键在于工程单价的确定问题。
会议室的工程，可以根据合同来确定价格。对于其他楼房主体工程，如果你们协商不成，可以共同委托一家工程评估机构来进行评估。
我是几家建筑公司的法律顾问，根据我办理的案件，如果对于工程量或价存在争议，一般是根据当地建委颁布的工程造价定额来确定的。最高人民法院对此曾有一个文件，作为依据。
根据我的经验，建筑类案件比较复杂，专业性强，和其他合同纠纷存在不同。建议您最好和律师电话联系，由律师对您的合同等进行全面审查后，做出一个判断为妥。
对有争议的工程量和定价及时保存证据或提出司法鉴定。虽然签订了施工合同，但是由于工程本身的不确定性，在施工过程中出现工程量的改变也就在所难免了。一般对于工程变更，要及时按照业主建设单位要求履行工程变更的认可手续。在律师的司法实践中，经常出现由于口头约定变更，导致工程结算时对工程量和定价发生争议导致诉讼发生的情况。对于这种情况，根据本律师经验，施工企业可以采取三种方式来维护自己利益，一是根据合同约定，如果合同的补充协议对这部分工程量做了约定则可以作为依据；二是没有合同约定的，可以根据当时施工双方以及监理单位、材料商等第三方的工程量确认证据来计算工程量；三是参照签订合同时建设行政主管部门发布的计价方法和计价标准结算工程款（一般指建造定额标准）；四是如果双方协商不成的，可以申请法院作司法鉴定（司法鉴定也是依据建筑定额标准鉴定）。对于上述四种途径，施工企业可以根据工程的具体情况选择采用。 我的补充： 2013-01-22 23:30

具体而言，您可以考虑采取风险代理的方式，由律师通过法律途径来确定工程价款数额，依法维权。