你好。劳动者拒不提供入职材料、签订书面合同的，单位可以以违法公司规章制度为由辞退。鉴于你们10月29日已经发函辞退了，故11月6日的病假申请无须理会。
当然，该员工很可能会提起劳动仲裁，届时公司需要做好应诉工作。

你好，这种情况最好协商处理，可考虑解除并支付一定补偿金的方式

员工拒绝签订劳动合同的，公司应当及时终止劳动关系。收集好证据，准备好应诉。 我的补充： 2014-11-18 15:26

若需帮助可来电或者添加本律师微信公众号详询。添加方法：打开微信-通讯录-添加朋友-查找公众号-搜索“叶雪飞”-关注！把私人律师装进手机，随时随地免费法律咨询！

1、如你所述，对公司不是有利。

2、建议尽快委托律师处理。

3、若需帮助，可来电或预约当面洽谈。

建议先协商，协商不成，准备应诉，收集并保留好员工存在过错的证据。如有问题可继续追问，或来电咨询。

如果该员工未出勤期间凭病假单请了病假，则请假有效。
女职工三期内，单位不能随意辞退职工，所以目前单位要谨慎处理。
建议公司聘请专业律师做顾问。

员工拒绝签订劳动合同的，公司应当及时终止劳动关系。收集好证据，准备好应诉。