根据《刑法》第213条的规定，假冒注册商标罪是指未经注册商标所有人的许可，在同一种商品上使用与其注册商标相同的商标，情节严重的行为。对假冒注册商标罪罪与非罪界限的认定需要对情节严重程度进行认定。根据我国刑法第213条的规定，情节严重程度是区别罪与非罪的关键，只有当行为人的情节达到一定程度才作为犯罪处理，否则则按一般的侵权行为处理。
一、对非法经营数额”的认定
“非法经营数额”的计算，对“情节严重”的认定起重要的作用。非法经营额是指行为人通过假冒注册商标获得的营业金额，包含销售金额和未销售商品的库存金额。销售金额是指销售商品没有扣除成本、税收的营业所得;库存金额是指库存产品以市场价格计算的应得。国家工商行政管理局、商标局1990年4月在给福建省工商行政管理局的批复中指出，“商品全部销售的，其销售金额为非法经营数额;商品尚未销售的，其购入的总贷款为非法经营数额，部分销售的，已售出部分的销售款总数加上尚未售出部门的购入货款之和为非法经营数额”。国家工商行政管理局在1994年出台的《关于执行<商标法>及其<实施细则>若干问题的通知》中指出，“非法经营数额包括假冒商品的销售额以及被查获假冒商品的货值之和”。
《知识产权犯罪解释》则将“非法经营数额”定义为，行为人通过侵犯他人知识产权获得的总价值，包括制造、存储、运输、售卖侵权产品所涉及的价值。行为人已经售出侵权产品的价值，按照产品的实际销售价格计算。制造、储存、运输和未销售的侵权产品的价值，按照行为人的标价或者根据已查清侵权产品的实际销售价格的平均数来计算。侵权产品还未标价或者没有查清其销售价格的，应当按被侵权产品的市场中间价格计算。我们认为，对“非法经营数额”的具体计算，应按照《知识产权犯罪解释》第12条的规定进行。因为对制造、贮存、运输侵权产品的行为是与销售行为紧密联系的，其已经侵犯了国家商标管理制度和商标所有人的合法权益，这样的规定更有利于商标管理。
二、对“违法所得数额”的认定
对“违法所得数额”的定义以及如何计算，1993年全国人民代表大会《关于惩治假冒注册商标罪的补充规定》将“违法所得数额较大”规定为销售假冒注册商标的商品罪成立的条件之一，而最高人民检察院发布的《关于假冒注册商标犯罪立案标准的规定》将“违法所得数额”解释为“销售收入”，实际上就是“销售金额”。之后，最高法院将其又解释为“获利数额”。由于两高对“违法所得数额”的解释出现差异，导致在司法实践适用中产生混乱。1997年刑法实施后，其中也没有明确“违法所得数额”认定标准。
因此，“违法所得数额”的明确具有认定犯罪，给予司法实践以统一指导的重要意义。我们认为应将“违法所得数额”认定为在除去成本后行为人所得到的利润。首先，如果将其认定为销售假冒商品后的全部收入，那么势必与“销售金额”相混淆。其次，也不能将违法所得数额与“非法经营数额”等同，否则会架空法律对其的规定。
三、关于侵害驰名商标的认定
我国在修订了的《驰名商标认定和保护规定》中将驰名商标定义为，“在中国为相关公众广为知晓的并且具有较高声誉的商标”。假冒在国际上享有声誉的注册商标不仅会误导消费者，损害注册商标专用权人的利益，也会使得我国在国际上的形象大打折扣。我国在立法上十分重视对驰名商标的保护，也不断加快对驰名商标的立法进程，根据《追诉标准》的规定，行为人实施了假冒驰名商标的行为，不论其获得多少非法经营数额，一律按照“情节严重”定罪处罚。要注意的是作为本罪犯罪对象的驰名商标必须是在我国注册的驰名商标。
此外，关于驰名商标淡化行为是否应当入罪是学界保护驰名商标的争论点。驰名商标的淡化行为，是指未经商标权人的许可，将与驰名商标相同或者相似的文字、图形极其组合在其他不相同或不类似的商品或服务上使用的行为。一种观点认为，在非同类的商品上擅自使用驰名商标，这种商标侵权行为的社会危害性并不比其他的商标侵权行为小;而且，一般的商标侵权行为与假冒注册商标犯罪之间仅是程度的差异，所以只要“淡化行为”情节严重，可以构成假冒注册商标罪。
四、对受行政处罚情况的认定
《追诉标准》对受过二次行政处罚的时间限制并未作出详细规定，究竟是在一年或者两年内还是不受时间限制，在追诉前的任何时间只要因假冒注册商标受过行政处罚两次以上均可是值得探讨的。在现实中，对于轻微违法活动，经过时间的推移，当事人思想和行为上可能已经发生极大的变化，追溯时效有利于社会稳定。根据其他犯罪中受过二次以上行政处罚，之后再次实施该行为被追究刑事责任的规定来看，大多数学者认为“两年内”的限制是相对合理的。因此可以考虑对由于假冒他人注册商标，已经受到两次以上的行政处罚，又再次假冒他人注册商标的行为人定罪时给予两年的时间限制。
此外，《追诉标准》计算犯罪数额时，对曾经受过行政处罚的违法数额是否一并计算也未作出明确的规定。本文认为不应当一并计算，行为人此前因同样的行为受到过两次行政处罚，如果再次对其进行处罚，是进行“重复评价”。
五、对“社会影响”的理解
根据《追诉标准》，是否造成社会影响也是评价“情节严重”的标准之一。社会影响是一个抽象的概念，但是认定造成恶劣的社会影响，也不是毫无根据，凭空想像的。我们要联系事件造成的群众反响，社会舆论，对社会秩序造成的混乱程度等综合因素进行考察才能得出结论。
根据假冒注册商标罪所侵犯的客体是注册商标所有人的合法权益以及国家商标管理制度，我们在评价一个行为是否造成恶劣的社会影响时，可以看它是否严重扰乱了国家商标管理制度，以及是否严重侵害了他人注册商标。例如，是否给他人的商业信誉和商品声誉造成了恶劣的影响，给他人造成巨大的经济损失;在社会上产生了不良影响，社会舆论反应强烈，消费者合法权益受到巨大的损耗。要避免对“社会影响”的规定不明确而成为真空条款。
 根据刑法第213条和220条的规定，犯假冒注册商标罪的，处3年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金，情节特别严重的，处3年以 7年以下有期徒刑，并处罚金。单位犯本罪的对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照上述规定处罚。