公司因员工辞职扣押工资的做法不合理，更不合法。如果公司有此违法行为，劳动者可向当地劳动监察部门反映，也可直接向劳动仲裁委员会申请仲裁。如果想和公司解除劳动关系，按照《劳动合同法》相关规定，劳动者离职应当提前三十日书面通知单位。但有下列情形之一的，可以随时解除劳动合同：在试用期内应提前三日通知单位;用人单位以暴力、威胁或者限制人身自由的手段强迫劳动的;未按劳动合同约定支付劳动报酬或保障劳动条件的;用人单位违章指挥、强令冒险作业危及劳动者人身安全的。