具体分析，如果代理跑了，可以立案，刑事诉讼。如果代理商承认，只是因为双方之间的经济往来不清，可以民事诉讼，

这不算挪用。代理商与被代理人之间存在民法上的代理关系，其收回的营业款应归被代理人所有，代理商未交回，是对代为保管的他人财物的非法占有，如果数额较大，该行为涉嫌侵占罪。按照我国刑法规定，对于该罪，告诉的才处理。你单位可以向法院提起诉讼。