我与朋友共同出资购买了一套商品房,购房协议是我们两个人共同签订的,钱也是我们共同出的,但是现在还未办
双方可以先签订协议,约定由房屋的份额抵偿债务。之后到公证处办理公证,等房产证办下来后双方到房管局办理过户即可,如出现纠纷或对方不配合你办理过户手续,可以起诉到法院,以公证的协议作为证据起诉对方要求履行协议。