如果数额比较大的话，不足以证明你已经足额支付了转让款，一般法院还会要汇款凭证；但是如果金额较小的话，可以证明。
个人认为你们可以经股权转让款数额约定较少，并且去工商部门办理变更登记，有助于保障你的权利。

建议采取股权转让形式，转让款可以低一些没有问题；你也可以支付给老板该股权转让款，老板也可以把钱还给你。主要问题一是工商变更要作；二款项通过银行转账形式进行。还有一种形式你可以通过技术入股成为股东之一。

可以用股权激励的方式解决，召开股东会议，修改公司章程，由A拿出10%奖励为公司做出杰出贡献的技术人员，这样就不用作假。

建议不要以做假的方式操作，如今后发生争议，法院总归能查清案件事实的。可来电详细咨询。