不合法,安全员证归你本人所有他人无权扣留

如你以前的公司已经拿到你的证件了而不发给你,你可以起诉到法院要求返还证件.如果公司没拿到,你就应找发证机关了,要么补发,要么就是重新领取了

如你的安全员证上的工作单位是该公司，而你现在又已离开该公司，则要与该公司协商处理

协商不成仲裁解决。