1、侵犯的客体不同。本罪侵犯的是公司、企业清算制度及债权人和其他人的合法权益，后罪则侵犯的是公司财务会计制度及股东和其他人的利益。
2、客观方面不同，首先两罪的时间要件不同。本罪只发生在公司、企业清算期间，后罪则是公司正常运作期间。犯罪的行为方式有所不同。本罪表现为隐匿财产、虚伪记载资产负债表和财产清单或者在未清偿债务前分配公司企业财产，而后罪主要表现为编制或者隐瞒重要事实的财务会计报告。
3、犯罪主体不同。本罪主体为公司、企业清算组的直接负责的主管人员和直接责任人员，而后者主体则为公司及其直接负责的主管人员和其他直接责任人员。
4、犯罪目的不同。本罪行为人的目的是逃避公司、企业债务，而后罪则是欺骗股东和社会公众，骗取他们的投资。