1.法院组织

明治维新初期，日本还没有系统的法院组织体系，司法与行政不分。1871年成立司法省，民刑裁判权统一由其监管，地方则由地方行政官兼任司法官。1875年制定《大审院各级法院职制章程》，规定大审院为全国最高司法机关，下设上等法院、巡回法院、府县法院，废除了地方官兼任司法官的制度，初步实现了司法与行政的分离。

明治宪法颁行后，按法国和德国的模式建立了普通法院和行政法院两个系统，并于1890年颁布了《裁判所构成法》和《行政裁判法》。《裁判所构成法》参照德国法院组织体系制定而成，规定全国设区法院、地方法院、控诉院、大审院，实行四级三审制。《行政裁判法》规定了行政法院组织以及行政诉讼原则和制度，共4章47条。法院规定在东京设立行政法院，只负责审理依法律、敕令及有关行政裁判文件所规定的行政违法案件。法律 敎育 网

2.诉讼制度

1890年日本政府参照德国刑事诉讼法，制定《刑事诉讼法典》，1890年10月公布，同年11月实施。

1885年日本政府在德国人铁肖指导下，完成民事诉讼法典草案，经法律调查委员会几度修改，于1890年4月公布，次年1月实施。这是日本第一部《民事诉讼法典》。