辅导期商贸企业一般纳税人取得的专用发票抵扣联、海关进口增值税专用缴款书和废旧物资普通发票以及货物运输发票要在交叉稽核比对无误后，方可予以抵扣。比对方式是数据传递到总局相关的比对系统进行比对。