根据《中华人民共和国房产税暂行条例》的规定，房产税由产权所有人缴纳。公司改制后，部分房产从原企业中剥离，如果剥离出来的房产产权也随之转移到新企业，就由新企业缴纳房产税；如果剥离出来的房产产权仍属原企业所有，只是由改制后企业代为管理，则应由原企业缴纳房产税。