股权转让协议有效,但办理工商变更登记需要股东会决议、章程修正案等文件，仅凭协议工商局不受理。

1、首先明确一点该协议是有效的，但是最关键的是你这个企业是有限公司还是合伙企业？企业的性质必需明确，企业的性质不同股东承担的责任也是不同的。
2、建议先电话或当面咨询律师维护您的合法权益。

1、如果公司章程对此没有禁止规定，这份协议是有效的。
《中华人民共和国公司法》第七十二条 有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。 公司章程对股权转让另有规定的，从其规定。
2、工商登记虽然不影响协议的成立和生效，但却起公示作用，未经登记则不得对抗善意第三人。
依据法律规定，公司应当在股东发生变更之日起30日内到工商行政管理机关办理变更登记（公司登记管理条例第31条第1款）。这种登记起到一种公示作用，登记之后可以对抗善意第三人，反之，不能对抗善意第三人。但是，变更登记不能直接决定股权转让协议的成立与生效与否：股权转让合同自股东会决议通过时生效（公司法第72条第2款）。注意：股权转让属于非营业执照登记事项，所以，股权变动不是公司规定的必须登记的事项（公司法第7条第2、3款）。

当面咨询

这个问题比较复杂。建议当面咨询律师后确定解决方案。本人专业经济律师，成功收费，需要联系我。

需要签署股份转让协议、章程修改条款、股东会议、工商变更等，预约律师详谈。

协议只要内容合法即有效，但发生股权变更应办理到工商局办理变更登记。
你可提出要求办理变更登记，彻底扫除隐患。

协议合法有效  登记不是生效的必要条件  变更登记可能需要对方配合  如果对方拒不配合  可以诉讼解决

你需要去工商局办理工商变更登记，才能对抗第三人。