工资应当发放，拖欠工资是违法的。工资应当按照合同约定发放,包括基本工资、奖金、津贴、提成等全部费用。拖欠或扣发工资违法，你可以要求全额发放，并支付拖欠部分25%的经济补偿金。超过合同约定工资发放日15天以上算拖欠。单位违法解除劳动合同，可以要求经济赔偿金，为经济补偿金的两倍。如果协商不成，带好相关资料到劳动监察部门投诉，或者直接到单位所在地的劳动仲裁委提出劳动仲裁。

《女职工劳动保护特别规定》第五条规定：“用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳降低其工资、予以辞退、与其解除劳动或者聘用合同。”因此，公司做法违法。建议您立即收集证据，申请劳动仲裁。您可以以公司违法解除劳动合同，并要求公司补发休假期间少发工资、欠发工资，并可以主张经济补偿金。

可以申请劳动仲裁

如果协商不成，带好相关资料到劳动监察部门投诉，或者直接到单位所在地的劳动仲裁委提出劳动仲裁。