你儿子饮酒驾驶摩托车应当有事故责任，具体是什么责任，由交警认定。按照事故责任赔偿。

一、交通事故责任报警后，由交警根据现场勘查、调查取证后根据行为与事故因果关系分析认定！当事人对道路交通事故认定有异议的，可以自道路交通事故认定书送达之日起三日内，向上一级公安机关交通管理部门提出书面复核申请。
二、具体赔偿数额根据责任、伤害程度，保险情况和个人、各地具体情况不同而不同，当面咨询当地律师吧！

具体责任，交警会作出认定。

不会分两个案件来处理，因为只发生了一起事故，你儿子的酒驾问题可以作为事故原因之一，交警会根据事故现场认定责任，酒驾只是是否要接受行政处罚或刑事处罚的一个情节。