你们合同中约定的很清楚，学校收回房屋与A无任何责任，对于定了该合同的风险你是知道的

你们不是约定了“如学校到期不再续签与A无任何责任”吗？

你们合同中约定的很清楚，学校收回房屋与A无任何责任，对于定了该合同的风险你是知道的

一般情况下，双方可以协商解决。

学校作为出租方禁止承租人A转租，但A转租给了B，所以你们这间签的合同是无效合同。无效合同自始无效，所以你们约定的“如学校到期不再续签与A无任何责任，如果学校因转让而收回房子也与A无关系。”也没有法律效力。
我认为你的损失是可以挽回的。