像您这种情况，首先你要了解企业的财务情况，看这两个合伙人投入资金的真实情况。由于不清楚你们当时签订的合伙协议是怎样约定出资的。根据《合伙企业法》的规定：合伙人可以约定利润的分配方式。一般情况下，是根据出资比例来分配利润。
你说的这两个合伙人后期投入资金这一行为的性质无法界定，到底是根据合伙协议履行约定的出资义务。还是后期追加投资。如果是前者，你要核查真实的出资情况，出资不足还是出资超过工商注册资本。出资不足，你也可以要求他们两个补足出资，并依据合伙协议承担违约责任。如果是他们两个真的出资超过工商注册资本，你们企业应该变更工商登记。
如果是追加投资的性质，看你们合伙协议的约定，或者合伙人之间进行协商，是够根据原始出资和追加投资金额的比例进行利润分配，如果没有约定，或者协商不成，还是应该依照原始出资比例分配利润，但是企业应该偿还这两个人的追加投资。
总的来说，你维护权益的途径是两个：一是追究这两个合伙人的违约责任（需要证据），而是要求退伙，清算资产。以上意见仅供参考！！！