不会有什么不利的，认定工伤和评残本来就是两个程序。只要发生事故或者职业病就可以进行工伤认定，但评残是指职工发生工伤后，经治疗伤情相对稳定后存在残疾、影响劳动能力的才进行的。而且自评残之日起1年后，有关人员或单位认为伤情发生了变化还可以要求重新进行伤残鉴定。