协议是有效的，但是无法保证房产所有权，因为房产所有权以登记为准，以后该房产办下房产证后应该是先登记在卖方名下，在经过规定的年限可以过后后卖方再过户给你，在房产没有过户给你以前，房产都不属于你所有。
所以你们的协议里应当明确规定何时过户，如果对方不过户需要怎样承担违约责任等，建议找律师代为起草协议。