你扣留的学费应该退还给学校，并和单位协商工资结算问题，如果学校不给，那就诉至劳动争议仲裁，通过法律途径解决。

你好，根据你所讲的分析如下：
     1、你的做法是不对的，如果资金数额达到一定标准，则你会涉嫌挪用资金罪或者职务侵占罪，可能会被追究刑事责任；当然你主观上不具有非法占有的故意，但是有这样的风险在里面，建议早日妥善处理；
     2、单位拖欠你的工资，你可以提起劳动争议仲裁，要求支付拖欠工资，甚至可以要求经济补偿等；
     如果需要法律帮助，请致电或者QQ：851885667（留言）咨询