你的做法违反了劳动合同法的规定和“协议”的约定，可能既拿不到9月份的工资，又因为旷工承担一定的责任。

工作应当照做。

公司不能扣留员工工资

公司只需要发放你实际工作时间的工资。

1、你9月18日提出辞职申请，原则上10月18日离职，这是劳动法的规定。在此期间，你必须上班，或用完休假，不然构成矿工。除非单位提早批准你离职。
2、10月18日可以拿到9月份至离职前的实际工作时间的工资。