本人新疆机场集团员工，自入职起两年工作严重超时，单位未按照合同规定的综合计算工时工作制安排工作时间 本人新疆机场集团员工，自入职起两年工作严重超时，单位未按照合同规定的综合计算工时工作制安排工作时间，同时签完劳动合同后单位拿走了全部的劳动合同，并未给本人保管。现如今辞职，单位不同意，并威胁扣留档案。这样的情况可以申请劳动仲裁吗？