一般的是不可以与怀孕期的员工解除劳动合同的，但是第三十九条 劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同： 
  （一）在试用期间被证明不符合录用条件的； 
  （二）严重违反用人单位的规章制度的； 
  （三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的； 
  （四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的； 
  （五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的； 
  （六）被依法追究刑事责任的。 
女职工怀孕只是排除了四十 四十一两条，没有排除三十九条
  所以该员工无故不来上班，是严重的违反了用人单位的规章制度可以与其解除劳动关系。