⑴、出资的权属问题
实践中，有人提出，知识产权出资方式应包括以知识产权的所有权出资和使用权出资。我们认为，以知识产权的所有权出资是没有疑问的，但是根据《公司法》有关非货币财产出资规定和立法精神，知识产权的使用权不允许作为非货币财产出资标的物，理由主要如下：
首先，《公司法》第28条规定“以非货币财产出资的，应当依法办理其财产权的转移手续”。根据该条规定，股东以非货币财产出资的，应当是以非货币财产的所有权进行出资，且出资后应办理相应的财产权过户手续。
股东人以著作权对公司的出资，本质上是以其著作权作为对价来换取其在公司的股权。因此，其出资的财产权利必须转移给公司，该著作权的利用方式亦是转移权利型的。可见，以知识产权出资至于转移的是“专有权”还是“使用权”，《公司法》第28条的规定是比较明确的。公司法要求的著作权出资是专有权的出资而不是使用权的出资，使用权的出资是无须办理产权转移手续的，因此按照新公司法28条的规定，该权利在用于出资后应当依法办理转让。
此外，《中外合资经营企业法实施条例》第29条规定“外国合营者以工业产权或专有技术作为出资，应提交工业产权或专有技术的有关资料，包括专利证或商标注册证书的复印件”，《外商企业法实施细则》中也有类似规定。可见，外商投资企业法中所要求的知识产权的出资，亦是专有权而非使用权的出资。
⑵、可否用知识产权部分转让的方式出资
我国商标法和专利法都有出资方用商标或专利技术转让方式出资，均应将特定商标或专利权整体完全转让出资的规定。但从国外立法和实践来看，这一规定似显僵化。以商标为例，我国《商标法实施条例》第25条第2款规定：“转让注册商标的，商标注册人对其在同一种或者类似商品上注册的相同或者近似的商标，应当一并办理。”实践中，众多公司尤其是名牌企业推行“名牌延伸”策略，一件商标往往注册使用于几种甚至更多种商品或服务上。从理论上讲，该企业出于生产经营目的是可以将该商标进行部分转让出资的。例如某公司将A商标分别注册于甲、乙、丙三种商品上，后来该公司因故停止生产经营丙商品，致使使用在丙商品上的A商标处于闲置状态，此时，该公司在不影响自己对A商标在甲、乙商品上的所有权的前提下，可以将用在丙商品上的A商标转让出资给其它公司。