一是应收账款的转让问题。应收账款属于债权的一种表现形式，本身具有可转让性。《物权法》第二百二十八条第二款规定，“应收账款出质后，不得转让，但经出质人与质权人协商同意的除外。出质人转让应收账款所得的价款，应当向质权人提前清偿债务或提存”。因而，应收账款在出质后，出质人即不得再转让所质押的债权，除非经质权人同意，并须将转让所得支付给质权人以清偿债务或在公证机关等机构进行提存。但是，应收账款虽然在质押时进行了登记，但应收账款的转让具有隐蔽性，出质人可能在应收账款出质后再将应收账款转让，这不但需要在签署质押协议时约定相应保障措施，在签约后进行相应监督，并在必要时由应收账款的债务人出具相应法律文件予以保障。

二是应收账款的清收与使用问题。应收账款是出质人对其债务人享有的已到期或未到期的债权，那么应收账款的相应债务人会在到期时清偿或未到期时提前予以清偿，对于债务因清偿应收账款而向出质人支付的款项应当如何处理，《物权法》和《登记办法》及《操作规则》均未予明确规定。但从应收账款质押担保的本质来看，应收账款因债务支付清偿款而消灭时，质押的标的灭失，此时作为质押标的的替代物——所收取的款项应当用于清偿应收账款所担保的债权或充当担保物。如果放任出质人支取和使用应收账款的相应债务人所支付的款项，那么质权人的利益就会受到损害、应收账款的质押担保就会失去保障功能。在法律法规未明确的情形下，就需要在设立应收账款质押时对此予以约定，即出质人应在应收账款的债务人支付清偿款项时，支付给质权人用于清偿所担保的债权或者提存。

三是应收账款在质押后的管理问题。质权人虽在应收账款质押后对其享有质押权，但应收账款仍处于出质人的管理之下，并且出质人是否有效管理应收账款会影响应收账款的有效性。这包括：出质人应在应收账款诉讼时效届满前，积极采取措施催要应收账款使诉讼时效得以重新计算，从而使应收账款得到法院司法强制力的保护；出质人应履行其与应收账款债务人的相应协议的约定，如按约定供应货物、提供服务或者履行退换货等售后服务，避免因重大违约导致应收账款债务人解除合同或依法、依约拒绝付款。对于这些管理义务，质权人应当在与出质人的应收账款质押协议中予以明确约定，以免因其未适当履行管理义务或采取法律措施导致应收账款丧失诉讼时效或丧失追索性。