因工作调动，老板要调我回珠海上班，原工作地在新会，工资没有谈妥，没去上班两天，今天去劳动局申请仲裁（

因工作调动，老板要调我回珠海上班，原工作地在新会，工资没有谈妥，没去上班两天，今天去劳动局申请仲裁（因劳动合同期满，继续为公司工作4月，现因薪资没有谈妥，老板说不去珠海没关系，因此我未离职也没被辞退而提出申请）。刚交完劳动仲裁的意见，公司就发出通知函，以我旷工为由让我自离。请问广大的律师们，我的劳动仲裁时为在职的时候申请，被自离后，申请是否继续有效？我被自离还能维权吗？