报名单位扣押证书不合法，让交纳2000元，更是违反劳动法的规定，可以向该单位明确告知其违反行为应当受到制裁，或向劳动监察部门投诉要求解决，也可以委托律师处理，给该单位发放律师函，拿回你的证书，维护你的权益。

这种行为是违法的，可以向劳动监察大队举报。