具体是否有区别要视拆迁人的依法制定的补偿安置方案为准。但，通常情况下，有证和没有证的土地性质是可能不同的。当前法律实践中一般不对集体土地上的房屋登记发证。因此，政府在制定补偿标准的时候，为体现政策利导性，通常会规定，有且只有在没有证的房主积极配合政府的情况下，按照有证的标准给予补偿；不积极配合被强制拆迁的，只按无证的标准给予补偿。当然，本案中的“有证”、无证的事实，要等政府调查核实后认定。你拿不出证，不代表就没有证，要以国土房管部门的登记簿为准的。政府会主动去查的。