申请工伤这个事情你无法阻止，你不是有工伤保险？可以从那里面出款。关于你的责任没什么就是赔偿问题。别的没有。

1、无院方转院建议并经社保同意的，社保不承担由此产生的医疗费，但其他工伤待遇社保基金应承担。
2、辞退若有法定依据的，不必承担赔偿责任。但倒扣工资于法无据。

如果工伤已被认定且评上等级，公司及社保要支付其工伤待遇。
公司如果合法辞退员工，无需支付补偿金，但不应克扣员工工资。但员工如果以克扣工资为由申请仲裁，公司就要支付经济补偿金。
具体还要看公司的规章制度是否合法及员工申请仲裁的理由等具体分析，如需法律帮助，可以与我联系。

社保应承担的责任，公司无须承担。单位应当承担的责任不变。