分为两部分，先处理交通事故再处理工伤，可以协议赔偿或者起诉。

先向肇事方索赔；再主张工伤赔偿。

你所咨询的是既构成交通事故又构成工伤的案件应当怎么索赔的问题。
1.关于交通事故的赔偿，因为你阐述得信息简单，无法具体回复你，需要问你一些问题。你说用了20多万元医药费，对方只给了4万多元，那是不是指你自己垫付了16万的医疗费？你被别人撞了，交警部门对事故责任是如何划分的？肇事司机和车主是不是同一个人？肇事车辆购买了交强险没有？肇事车辆购买了多少万元限额的商业三者险？肇事司机有没有赔偿能力？
2.关于工伤待遇部分。单位是否给你购买工伤保险？单位或者你自己是否已经向人社局申请工伤认定？
3.交通事故的赔偿和工伤待遇部分项目可以同时获得，不冲突，简单点说就是部分项目可以双赔。
4.你看到回复后，可以追问或者来电咨询，最好来电咨询，简单直接。一个电话可以解答清你所有的疑问和疑惑。我们的免费咨询电话：185 7315 7775