答：申请---过半数股东同意---股东会决议---变更登记。

这个恐怕问题很复杂
首先，你是不是股东，还不明白
根据你所说的情况，我估计你还不是股东，没有去变更过手续。
再说，分店，一般的没有股东的，只是总店的一个分支机构，不是独立的主体

起诉返还款项。

上海多年执业律师为你解答： 
仅有收款收据是很难证明你就是股东的，而且分店是没有股东的。
你这个问题比较复杂。