我在今年年初接了一个学校的监控网络多媒体安装工程，在工程开工前 我在今年年初接了一个学校的监控网络多媒体安装工程，在工程开工前，我提交了合同，且作为乙方我已经在合同上盖了章，甲方当时拿过去后，一直没有盖章发回我的那份，过段时间我催要合同，甲方就说合同不见了，前前后后我一共给了三份同样合同给甲方直到工程结束，一直以公司款还没到位等理由拖延尾款，这两天到底付款了，可过了两天，又提出合同没有的一条条款，说要扣留总款的10％作为保证金，而且要扣半年，这个请问要如何处理？