可以申请认定工伤，只要能提供劳动关系的证明就可以。

乘坐公司车辆?该公司与你公司有联系吗？上班过程中，为什么要坐别的公司的车辆是被指派的，还是自己乘坐？

如果是后者，肯定不是工伤。

你的问题在法律上称竞合，即劳动合同工伤与交通事故侵权的竞合，在这种情况下，你可以选择交通事故处理，也可以按工伤处理，但按工伤处理，应该先进行工伤认定，后进行工伤仲裁较麻烦。建议你直接走交通事故处理较好。

  
可以申请认定工伤，只要能提供劳动关系的证明就可以 
 

先由交通肇事责任方赔偿，不足部分申请工伤待遇。