按照拆迁前计算

你母亲现在健在，还没有遗产。因为《继承法》规定，从被继承人死亡时才存在遗产继承。
如果拆迁房屋登记的名字仍然是你母亲的，二女儿出资也只能是借款给你母亲，不能当然视为其对新房有一部分产权，除非她和你母亲有协议。
假设你母亲在拆迁房屋产权办完后去世，拆迁后所得新房就是你母亲的遗产，当然，如果你母亲和二女儿有协议另当别论。