算工伤。

这当然 是工伤   作为受害方  你儿子即可以要求肇事方赔偿   也可以要求单位承担工伤事故待遇赔偿

根据《工伤保险条例》等相关法律法规的规定，在上下班途中，劳动者受到非本人主要责任的交通事故伤害的，应当认定为工伤。你儿子要求肇事方赔偿的同时也可要求用人单位进行工伤待遇赔偿（但已赔偿的医疗费用不可再主张）。
    如果用人单位不赔偿还要扣工资，建议你儿子及时申请工伤认定，通过法律途径维护其合法权益。

算工伤

属于工伤，可以主张双重赔偿，即可以机动车道路交通事故纠纷为由主张赔偿，还可以要求用人单位支付工伤保险待遇。

这个是工伤,单位是不能扣工资的,而且还必须按时发工资.建议你儿子申请工伤认定,要求公司按工伤待遇进行赔偿.

你说的这种情况，你儿子在作为交通事故受害人的同时，其在上下班过程中出现交通事故，依法应当认定为工伤，
而且，你儿子的情况，按现行规定，是可以同时得到工伤待遇和交通事故赔偿  
也就是说，他可以得双份赔偿的
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