没遗嘱遗产继承纠纷 原来家里有两间二楼砖瓦房.十多年多我父亲因车祸去世.赔偿二十多万,后来被母亲用于购房.没有财产分配,然后我也离家出门打工.03年的时候她又把新买的房子卖掉,并把原来的老房子其中一间和仓库及晒谷场造成了现在的三楼两间.并没有在相关部门取得批文,三年前我母亲因工伤去世,也得了八万赔款,没有其它分配,写在遗产分配协议中,这两间三楼及一处仓库归我兄弟,我分得最边上的原来二楼一间.场地天井按房子宽度直出......我目前想要取得公证的文件,但是违章房不批准导致我合法部份也无法公证.请问这样情况我应该怎么申诉.......