可以协议约定。

协议后在协议人之间有效。
工商登记后对第三人有效。

去工商部门备案登记。

签订好股份转让协议，这个协议本身就在法律上生效了，对协议人之间有效。
然后去工商局进行变更，才能对抗第三人。

登记后生效。

支付款项并签订好股份转让协议后就法律上生效。
中华人民共和国公司法

　第三十三条　有限责任公司应当置备股东名册，记载下列事项： 
　　（一）股东的姓名或者名称及住所； 
　　（二）股东的出资额； 
　　（三）出资证明书编号。 
　　记载于股东名册的股东，可以依股东名册主张行使股东权利。 
　　公司应当将股东的姓名或者名称及其出资额向公司登记机关登记；登记事项发生变更的，应当办理变更登记。未经登记或者变更登记的，不得对抗第三人。