如果是协议离婚，那在南京办不起来，要到原婚姻登记机关去办理，如果是诉讼离婚，如果能提供在南京已经工作居住一年以上的证据，那可以向被告现经常居住地所在法院提起离婚诉讼。

经常居住地在南京的话，可以在南京的法院通过诉讼解决。