我爸爸在农村有一套集体土地所有权的住宅，平房。已办理房产证。2017年购买了一套二手商品房 我爸爸在农村有一套集体土地所有权的住宅，平房。已办理房产证。2017年购买了一套二手商品房，办理过户时，契税是按照购买二套房标准收取的。今年我听说农村房子不算商品房，而二套房是指第一套房子为国有土地所有权的房子。请问税收部门按照二套房收费合理吗？