可以由公司规章制度来确认，但该规章制度应经职工代表大会讨论制定并公示和告知员工。

《企业职工奖惩条例》及《工资支付暂行规定》明确，若因职工原因造成用人单位损失的，用人单位可以主张职工进行赔偿。
若用人单位有明确合法的规章制度，可以依据规章制度进行操作。
若仍有疑问，可以电话咨询或预约当面咨询。