交通事故保险赔偿问题~ 各位您好：
    我的父亲在七月初出了一起交通事故，事故是这样的，早上下大雨，能见度比较低，早上我的父亲在去上班的路上与一辆大的货车撞在一起，我的父亲的摩托车与大车的后轮蹭在一块并弹出去（因我的父亲没有任何的印象，司机又完全不知道情况，这是通过后来的现场分析得出）我的父亲在医院待了38天，现在已出院，重伤部位在头部，脸部多处擦伤，缝了二三十针，头部脑震荡，目前看来恢复情况基本良好。事故发生后，大车被扣在交警队中半个月，后来车主与我们协商，他暂垫四万医药费把车提出，待事故鉴定结果出来后走法律程序，找保险公司索赔，有双方协议在手。我父亲住院花费在七万左右。前两天刚刚出来责任认定书，对方主要责任，我父亲是次要责任，对方有交强险，据说还有一个保额五十万的商业保险，这两个保险是该如何接照这个事故责任赔偿呢？按照我查的资料，我了解的大约是这样，不知识对不对：假设双方事故责任双方损失最终费用核算为10万元，那么对于我方可获得赔偿为：1万（交强险医药费）+（10万-1万）*75%（假设对方责任比率为75%）=7.75万，也就是说，超过一万的医药费，交强险最多报一万，扣除一万后其余的九万按双方责任分成，由其商业保险支付，对吗？再一个就是双方责任损失费用是由谁来核算？交警部门吗？希望大家能帮我解决，谢谢大家！