因读研而解除就业协议的问题 您 好

我是2012届的应届毕业生，我参加了今年的研究生入学考试，

因为开始复试没有通过，所以我找了份工作。签了协议，协议上我和对方都 有签字，但学校也没有盖章，协议全部还在我手里，没有去学校登记。但过了一段时间，我又被通知录取了。
所以打电话给对方企业，告知还是打算读研了。
可协议上有关于  升学的补充条款，处理办法没有写，内容如下：
甲乙双方 就乙方由于参加国家就业项目、升学等无法履行本协议的情况达成如下处理办法：（    ）   

对方让我付全额的违约金。
 我想请教您一下，这种情况下三方协议怎么解除 ？如果公司不放我真的要交违约金吗？另外我能申请劳动仲裁吗？