1.对政策性搬迁范围进行了明确的界定 国税函[2009]118号文件规定，本通知所称企业政策性搬迁和处置收入，是指因政府城市规划、基础设施建设等政策性原因，企业需要整体搬迁(包括部分搬迁或部分拆除)或处置相关资产而按规定标准从政府取得的搬迁补偿收入或处置相关资产而取得的收入，以及通过市场(招标、拍卖、挂牌等形式)取得的土地使用权转让收入。
通知中只是笼统地把因政府城市规划、基础设施建设等政策性原因发生的企业搬迁界定为政策性搬迁，但哪些属于政府城市规划、基础设施建设，通知中并没有明确说明。
鉴于此，《办法》在第三条给与了明确规定。根据办法的规定，企业政策性搬迁，是指由于社会公共利益的需要，在政府主导下企业进行整体搬迁或部分搬迁。企业由于下列需要之一，提供相关文件证明资料的，属于政策性搬迁：
(1)国防和外交的需要;
(2)由政府组织实施的能源、交通、水利等基础设施的需要;
(3)由政府组织实施的科技、教育、文化、卫生、体育、环境和资源保护、防灾减灾、文物保护、社会福利、市政公用等公共事业的需要;
(4)由政府组织实施的保障性安居工程建设的需要;
(5)由政府依照《中华人民共和国城乡规划法》有关规定组织实施的对危房集中、基础设施落后等地段进行旧城区改建的需要;
(6)法律、行政法规规定的其他公共利益的需要。”
2.对政策性搬迁收入的内容进行了界定
《通知》中并没有对搬迁收入的内容进行规定，《办法》在第五条至第七条给与了补充。根据《办法》规定，企业的搬迁收入，包括搬迁过程中从本企业以外(包括政府或其他单位)取得的搬迁补偿收入，以及本企业搬迁资产处置收入等。
企业取得的搬迁补偿收入，是指企业由于搬迁取得的货币性和非货币性补偿收入。具体包括：
(1)对被征用资产价值的补偿;
(2)因搬迁、安置而给予的补偿;
(3)对停产停业形成的损失而给予的补偿;
(4)资产搬迁过程中遭到毁损而取得的保险赔款;
(5)其他补偿收入。
企业搬迁资产处置收入，是指企业由于搬迁而处置企业各类资产所取得的收入。
企业由于搬迁处置存货而取得的收入，应按正常经营活动取得的收入进行所得税处理，不作为企业搬迁收入。
3.对搬迁支出的内容进行了界定
《通知》中没有专门规定搬迁支出，只是在搬迁所得的计算公式中涉及到了可扣除的支出。
《办法》在第八条至第十条对搬迁支出的内容进行了规定，以提高该文件的可操作性。
根据《办法》规定，企业的搬迁支出，包括搬迁费用支出以及由于搬迁所发生的企业资产处置支出。
搬迁费用支出，是指企业搬迁期间所发生的各项费用，包括安置职工实际发生的费用、停工期间支付给职工的工资及福利费、临时存放搬迁资产而发生的费用、各类资产搬迁安装费用以及其他与搬迁相关的费用。
资产处置支出，是指企业由于搬迁而处置各类资产所发生的支出，包括变卖及处置各类资产的净值、处置过程中所发生的税费等支出。
企业由于搬迁而报废的资产，如无转让价值，其净值作为企业的资产处置支出。
4.对搬迁资产的税务处理进行了规定
企业政策性搬迁所涉及的资产，《办法》中区分四种情况进行处理：
(1)企业搬迁的资产，简单安装或不需要安装即可继续使用的，在该项资产重新投入使用后，就其净值按《企业所得税法》及其实施条例规定的该资产尚未折旧或摊销的年限，继续计提折旧或摊销。
(2)企业搬迁的资产，需要进行大修理后才能重新使用的，应就该资产的净值，加上大修理过程所发生的支出，为该资产的计税成本。在该项资产重新投入使用后，按该资产尚可使用的年限，计提折旧或摊销。
(3)企业搬迁期间新购置的各类资产，应按《企业所得税法》及其实施条例等有关规定，计算确定资产的计税成本及折旧或摊销年限。企业发生的购置资产支出，不得从搬迁收入中扣除。
这一条规定和《通知》有较大区别，按照《通知》规定，搬迁收入准予扣除固定资产重置支出。
(4)企业搬迁中被征用的土地，采取土地置换的，换入土地的计税成本按被征用土地的净值，以及该换入土地投入使用前所发生的各项费用支出，为该换入土地的计税成本，在该换入土地投入使用后，按《企业所得税法》及其实施条例规定年限摊销。
5.应税所得如何清算
(1)清算的时点
《办法》规定，企业在搬迁期间发生的搬迁收入和搬迁支出，可以暂不计入当期应纳税所得额，而在完成搬迁的年度，对搬迁收入和支出进行汇总清算。
企业的搬迁收入，扣除搬迁支出后的余额，为企业的搬迁所得。
企业应在搬迁完成年度，将搬迁所得计入当年度企业应纳税所得额计算纳税。
(2)搬迁完成年度如何确定
《办法》第十七条 下列情形之一的，为搬迁完成年度，企业应进行搬迁清算，计算搬迁所得：
(一)从搬迁开始，5年内(包括搬迁当年度)任何一年完成搬迁的。
(二)从搬迁开始，搬迁时间满5年(包括搬迁当年度)的年度。
企业边搬迁、边生产的，搬迁年度应从实际开始搬迁的年度计算。
这个规定基本和《通知》规定也有一定的差别，《通知》中规定，规划搬迁次年起的五年内，其取得的搬迁收入或处置收入暂不计入企业当年应纳税所得额，在五年期内完成搬迁的，企业搬迁收入按上述规定处理。这就意味着5年内不管是否完成搬迁都不用清算，但按照《办法》的规定，5年内只要在任何一年完成搬迁，就要清算，5年后未完成搬迁也是同完成进行清算。
(3)政策性搬迁损失如何进行税务处理?
企业搬迁收入扣除搬迁支出后为负数的，应为搬迁损失。搬迁损失可在下列方法中选择其一进行税务处理：
(一)在搬迁完成年度，一次性作为损失进行扣除。
(二)自搬迁完成年度起分3个年度，均匀在税前扣除。
上述方法由企业自行选择，但一经选定，不得改变。
这条规定在《通知》中并没有明确。
(4)那些情形视同完成搬迁?
根据《办法》第十九条 企业同时符合下列条件的，视为已经完成搬迁：
(一)搬迁规划已基本完成;
(二)当年生产经营收入占规划搬迁前年度生产经营收入50%以上。
6.政策性搬迁时，企业亏损弥补期限如何计算?
企业以前年度发生尚未弥补的亏损的，凡企业由于搬迁停止生产经营无所得的，从搬迁年度次年起，至搬迁完成年度前一年度止，可作为停止生产经营活动年度，从法定亏损结转弥补年限中减除;企业边搬迁、边生产的，其亏损结转年度应连续计算。
7. 其他征收管理规定
(1)政策性搬迁需要向税务机关报送哪些材料?何时报送?
企业政策性搬迁，应该单独进行税务管理和会计核算。不能单独进行的，应按企业自行搬迁或商业性搬迁进行所得税处理，不得执行《办法》规定。
鉴于政策性搬迁情况比较复杂，容易产生征管漏洞，《办法》要求，企业应当自搬迁开始年度，至次年5月31日前，向主管税务机关(包括迁出地和迁入地)报送政策性搬迁依据、搬迁规划等相关材料。逾期未报的，除特殊原因，经主管税务机关认可外，搬迁收入和以后实际发生的、与搬迁相关的各项支出，均应按《税法》规定进行税务处理。此外，企业在搬迁完成年度，向主管税务机关报送企业所得税年度纳税申报表时，还应同时报送《企业政策性搬迁清算损益表》及相关材料。
(2)企业搬迁的其他事项如何处理?
由于《办法》规定的内容有限，且企业搬迁还会涉及许多一般性事项，因此《办法》未规定的企业搬迁事项，一律应按照《税法》及其实施条例相关规定进行企业所得税处理。
(3)政策性搬迁与非政策性搬迁的税务处理有何区别?
《办法》中对政策性搬迁所做出的规定，与非政策性搬迁的主要区别体现为：一是，企业取得搬迁补偿收入，不立即作为当年度的应税收入征税，而是在搬迁周期内，扣除搬迁支出后统一核算;二是，给予最长五年的搬迁期限;三是，企业以前年度发生尚未弥补的亏损的，搬迁期间从法定亏损结转年限中减除。