行政许可的实施程序可以分为普通程序制度和特别程序制度两个部分。

普通程序制度，包括申请与受理、审查与决定、期限、听证、变更与延续。其中有以下几类规则尤其应当得到重视：第一是申请人对其申请材料实质内容的真实性负责；第二是行政机关在审查申请的过程中，应当听取申请人、利害关系人的意见，申请人、利害关系人有权进行陈述和申辩；第三是行政机关依法作出不予行政许可的书面决定的，应当说明理由，并告知申请人享有依法申请行政复议或者提起行政诉讼的权利：第四是通过举行听证进行审查决定的，行政机关应当根据听证笔录，作出行政许可决定。

特别程序制度，包括国务院实施行政许可，特别许可，赋予公民特定资格和赋予法人或者其他组织特定资格、资质，对重要设备、设施、产品和物品进行的检验、检测和检疫，确定企业或者其他组织主体资格，有数量限制的行政许可。行政许可法有关上述制度的特别规定具有优先适用的效力。没有作出特别规定的，才适用普通程序的规定。