证券登记结算机构是指为证券交易提供集中的登记、托管与结算服务的不以营利为目的的法人。所谓“不以营利为目的”，是指不为设立人赚取利润，而并非指开展自己的业务活动时不收取有关的费用。

就目前的情况来看，上海证券交易所和深圳证券交易所有各自成体系的结算系统，上海证券中央登记结算公司是上交所的全资公司，负责上交所证券交易的登记结算工作；深圳证券结算公司是深交所的全资公司，负责深交所证券交易的登记结算工作。我国《证券法》规定，证券登记结算采取全国集中统一的运营方式。